探針的來源 DNA探針根據(jù)其來源有3種:一種來自基因組中有關(guān)的基因本身,稱為基因組探針(genomic probe);另一種是從相應(yīng)的基因轉(zhuǎn)錄獲得了mRNA,再通過逆轉(zhuǎn)錄得到的探針,稱為cDNa 探針(cDNa probe)。與基因組探針不同的是,cDNA探針不含有內(nèi)含子序列。此外,還可在體外人工合成堿基數(shù)不多的與基因序列互補的DNA片段,稱為寡核苷酸探針。2.探針的制備 進行分子突變需要大量的探針拷貝,后者一般是通過分子克?。╩olecular cloning)獲得的??寺∈侵赣脽o性繁殖方法獲得同一個體、細胞或分子的大量復(fù)制品。當制備基因組DNA探針進,應(yīng)先制備基因組文庫,即把基因組DNA打斷,或用限制性酶作不完全水解,得到許多大小不等的隨機片段,將這些片段體外重組到運載體(噬菌體、質(zhì)粒等)中去,再將后者轉(zhuǎn)染適當?shù)乃拗骷毎绱竽c肝菌,這時在固體培養(yǎng)基上可以得到許多攜帶有不同DNA片段的克隆噬菌斑,通過原位雜交,從中可篩出含有目的基因片段的克隆,然后通過細胞擴增,制備出大量的探針。
為了制備cDNA 探針,首先需分離純化相應(yīng)mRNA,這從含有大量mRNA的組織、細胞中比較容易做到,如從造血細胞中制備α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,就可以合成與之互補的DNA(即cDNA),cDNA與待測基因的編碼區(qū)有完全相同的堿基順序,但內(nèi)含子已在加工過程中切除。